Organizacja szkolnictwa wyższego w Portugalii opiera się o system dualny, obejmujący kształcenie uniwersyteckie i politechniczne, funkcjonujący na uczelniach państwowych, prywatnych i prowadzonych przez partnerstwa.
Uczelnie wyższe są uprawnione do prowadzenia kształcenia innego niż wyższe, np. kursów policealnych w ramach specjalistycznego kształcenia zawodowego. Osoby, które ukończyły takie kursy mogą ubiegać się o miejsce na studiach wyższych na pokrewnych kierunkach, a kursy policealne mogą być uznane za część tych studiów.
Obowiązują następujące warunki wstępu na studia wyższe: ukończenie szkoły średniej lub kształcenia na równorzędnym poziomie, zdanie egzaminów wstępnych z określonych przedmiotów zgodnie z wybranym kierunkiem studiów z wynikiem min. 95 punktów oraz spełnienie innych warunków dla kandydatów na danym kierunku.
Liczba miejsc na studia wyższe jest ograniczona zgodnie z zasadą numerus clausus.
W ramach szkolnictwa wyższego przyznaje się następujące tytuły akademickie: licencjat (licenciado), magister (mestre) i doktor (doutor).
Uniwersytety i politechniki przyznają stopnie akademickie licenciado i mestre.
Studia prowadzące do uzyskania stopnia licenciado w ramach studiów politechnicznych obejmują zazwyczaj 180 punktów kredytowych i trwają co najmniej 6 semestrów.
Studia prowadzące do uzyskania stopnia licenciado w ramach studiów uniwersyteckich obejmują od 180 do 240 punktów kredytowych i trwają od 6 do 8 semestrów.
Studia prowadzące do uzyskania stopnia mestre obejmują 90 do 120 punktów kredytowych i trwają od 3 do 4 semestrów.
Stopień akademicki doutor jest przyznawany tym studentom, którzy w ramach studiów doktoranckich przeprowadzili zaawansowane badania naukowe w wybranej dziedzinie i zaprezentowali wyniki podczas obrony pracy doktorskiej.
Czesne określane jest przez poszczególne uczelnie zależnie od rodzaju i jakości oferowanych studiów.