Polacy stworzyli innowacyjne oprogramowanie biotechnologiczne
Polska firma biotechnologiczna opracowała i wypuściła na rynek innowacyjne oprogramowanie służące do modelowania molekularnego białek - Selvita Protein Modeling Platform (SPMP).
Rdzeniem pakietu są zaprojektowane przez polskich naukowców unikalne algorytmy do modelowania białek, których skuteczność została wielokrotnie potwierdzona w międzynarodowych konkursach akademickich. Dodatkowe elementy programu to narzędzia do wizualizacji molekularnej oraz analizy struktury i sekwencji, umożliwiające efektywne wspomaganie badań nad strukturą białek.
Podstawowym założeniem projektu SPMP 2.0 jest wykorzystanie i integracja najnowszych osiągnięć w zakresie bioinformatyki z przyjaznym dla użytkownika interfejsem, obsługiwanym przez przeglądarkę internetową. Rozwiązanie takie zapewnia nieograniczoną przenośność aplikacji, bardzo cenną w multidyscyplinarnych projektach naukowych.
Najnowsza wersja SPMP zawiera m.in. zestaw narzędzi do
modelowania i przewidywania struktur protein oraz kompleksów
białko-białko na podstawie sekwencji aminokwasowej. Jest sterowana
poprzez graficzny interfejs webowy, dostosowany do obsługi zarówno
przez zaawansowanych, jak i początkujących użytkowników.
"Od wielu lat komputerowe przewidywanie struktury białka wspomaga projektowanie nowych leków dostarczając bezcennej informacji o strukturze białkowych celów biologicznych czy też ich kompleksów. Jednym z najbardziej interesujących zastosowań komputerowych narzędzi jest projektowanie nowych przeciwciał należących do najbardziej obiecujących leków przyszłości. Selvita Protein Modeling Platform 2.0 dostarcza komplet narzędzi stanowiących niezbędny dzisiaj element komputerowego wsparcia w wysiłkach naukowców w badaniach nad nowymi przeciwciałami" - zapewniał dr Nicolas Beuzen, dyrektor ds. naukowych Selvity, ogłaszając premierę oprogramowania.
Podstawowe moduły SPMP 2.0 to: modelowanie homologiczne białek (obejmuje procedury umożliwiające otrzymanie struktury białka na podstawie podobieństwa ewolucyjnego, przy wykorzystaniu sekwencji białka), dokowanie białko-białko (czyli przewidywanie budowy kompleksów proteinowych na podstawie wymodelowanych lub eksperymentalnie otrzymanych struktur poszczególnych), modelowanie pętli (przewidywanie struktury pętli wyłącznie na podstawie sekwencji aminokwasowej) oraz modelowanie de novo (otrzymywanie struktury białek wyłącznie na podstawie sekwencji aminokwasowej, bez wykorzystywania wiedzy o podobieństwie ewolucyjnym).
Selvita to polska firma biotechnologiczna, zajmująca się produkcją rozwiązań dla branży farmaceutycznej i biotechnologicznej. Obszary działalności firmy to: komputerowe wspomaganie projektowania leków (usługi i software), oprogramowanie do zarządzania laboratorium, synteza chemiczna oraz usługi analityczne. (PAP)
poleca:
