Szybka detekcja bakterii

"Bardzo szybka identyfikacja mikroorganizmów jest niezbędna w wielu dziedzinach życia, poczynając od identyfikacji drobnoustrojów, które zainfekowały organizm, kończąc na błyskawicznym określeniu gatunków bakterii zastosowanych jako broń biologiczna" - mówi prof. R. Graham Cooks z Purdue University.

Naukowcy współpracujący z prof. Cooks'em opracowali nowe urządzenie, za pomocą którego możliwa jest identyfikacja bakterii do gatunku w około 10 minut.

Metoda wykorzystuje specjalnie zmodyfikowaną technikę spektrometrii masowej DESI MS (ang. desorption electrospray ionisation mass spectrometry). W tego typu analizach całe, niezniszczone komórki bakteryjne rozpylane są wraz z jonizującym rozpuszczalnikiem przy wlocie do analizatora spektrometru masowego, dzięki czemu nie ma konieczności specjalnego przygotowywania próbek do analiz. Korzystając ze spektrometru masowego DESI naukowcy zbadali różne próbki zawierające określone drobnoustroje, które tworzyły kolonie bakteryjne o znanym kształcie i składzie gatunkowym.

"Różne próbki pobrane z jednej kolonii dawały identyczne wyniki (widma masowe), pobrane z podobnych morfologicznie kolonii tego samego gatunku dawały podobne wyniki, a zupełnie różne gatunki dawały całkowicie odmienną odpowiedź spektrometryczną" - wyjaśnia prof. Cooks. Rozróżnienie pomiędzy poszczególnymi gatunkami jest możliwe dzięki określeniu różnic w zawartości kwasów tłuszczowych oraz fosfolipidów.

By móc powszechnie zastosować nowo opracowaną technikę detekcji drobnoustrojów (np. w gabinetach lekarskich, karetkach pogotowia czy lotniskach itp.) naukowcy zminiaturyzowali dotąd ogromne urządzenie badawcze (spektrometr masowy DESI) do rozmiarów pudełka na buty. Według profesora R. Graham'a Cooks'a niezbędne jest stworzenie, na bieżąco aktualizowanej, biblioteki mikrobiologicznej, w której gromadzone byłyby bakteryjne "odciski palców", czyli spektroskopowe widma masowe charakterystyczne dla danego gatunku bakteryjnego. (PAP)